DNA 序列工具箱 — 免费在线工具

DNA 序列工具箱是 CintaBox 芯塔盒在线工具箱提供的免费在线工具：贴一段 DNA / RNA 序列（纯文本、FASTA、GenBank 都行，空格和编号自动去掉），做分子生物学里最常用的几件事：

⭐ **反向互补**：另一条链按 5′→3′ 读出来；也能单纯互补、单纯反向、DNA ↔ RNA。认 IUPAC 简并碱基（N、R、Y…）。分块编号显示，下载 FASTA。

⭐ **六框翻译**：正反两条链、三个读框一起翻，终止密码子标红；27 套遗传密码（标准、脊椎动物线粒体、细菌…）。

⭐ **找 ORF**：两条链六个读框里找开放阅读框，可设最短长度、只认 ATG 还是认密码表里的全部起始密码子（细菌的 GTG / TTG），位置图一眼看清，一键复制蛋白序列。

⭐ **酶切位点**：72 个常用限制性内切酶（EcoRI、BamHI、HindIII、NotI、BsaI…，REBASE 数据）逐个找，给切点、片段长度、粘端 / 平端，单切点画在位置图上；线性 / 环状（质粒）都行，还列出一刀都不切的酶。

⭐ **查找与 PCR**：查找认简并碱基、两条链都找、命中处标在序列上；贴一对引物看能扩出多大的产物（引物 5′ 端带酶切尾巴也行）。

⭐ **两条序列比对**：测序结果和参考序列排齐，一眼看出突变、缺失、插入；全局 / 局部、仿射空位罚分可调，蛋白自动用 BLOSUM62，相同率、相似率、空位数一起给。

⭐ **蛋白质参数**：贴蛋白序列直接给分子量、等电点、GRAVY、不稳定指数、280 nm 消光系数（从 A280 算浓度用）。

⭐ **引物 Tm**：最近邻法（SantaLucia 1998），可调 Na⁺ / Mg²⁺ / dNTP / 引物浓度，7 种盐校正（含 PCR 推荐的 Owczarzy 2008）；同时给 ΔH、ΔS、ΔG、GC 含量、3′ 端 G/C、单碱基重复、回文提示。

⭐ **大序列也不卡**：几 Mb 的细菌基因组直接贴，1 Mb 翻译六个读框不到 0.2 秒；长结果只显示开头，六框翻译可下载 FASTA，全部 ORF 可导出 CSV（Excel 直接打开）。手机上也好用。

⭐ **算得准**：Tm（420 条、7 种盐校正）、翻译（27 套密码表）、反向互补、分子量都与 Biopython 逐条对过，Tm 最大差 1e-13 °C。

**它做不了什么**：没有多序列比对、引物二聚体 / 发夹分析；不联网查 GenBank / BLAST。序列只在浏览器里处理，不上传。无需注册、无需安装软件，打开网页即可使用，处理全程在浏览器本机完成，文件不上传服务器。